Станимир Стоилов обяви, че напуска поста старши треньор на Левски. „Дали ще продължа да работя? Отговорът ми е „не”. Нещата, които най-вече ме притесняват, е начинът на управление и решенията, които се взеха в управленски стил”, мотивира решението си той. „Оставям един клуб с изключително добро бъдеще. Оставям отбор. Няма мач, в който да не е изглеждал като отбор, срещу който и да е противник. Никога не сме били надигравани или жалки”, добави Стоилов.По думите му „бъдещето е добро”, но въпросът бил оттук нататък да се взимат „умни решения”.

Така вторият престой на Мъри начело на „сините“ приключва точно преди дербито с ЦСКА следващия понеделник. Стоилов се завърна на стадион „Георги Аспарухов“ в началото на септември 2021 година. Повторният му дебют беше срещу Локомотив в Пловдив и завърши при равенство 2:2.

Най-голямото постижение на наставника беше спечелената Купа на България през май 2022 година, когато Левски победи с 1:0 големия си съперник ЦСКА във финала на стадион „Георги Аспарухов“. В общо 62 мача Станимир Стоилов постигна 34 победи, 15 равенства и 13 загуби с голова разлика 96:47.